Les élèves peuvent s'inscrire à des cours en ligne qui donnent droit à des crédits universitaires ou suivre des cours dans des établissements d'enseignement supérieur locaux, y compris le Cape Cod Community College. Les élèves qui terminent ces cours recevront des crédits de l'école secondaire sur leur relevé de notes JPII et des crédits de l'établissement d'enseignement supérieur choisi.
John Paul II a conclu un partenariat avec le Stonehill College afin de proposer certains cours de niveau 100 et 200, enseignés par le corps professoral du Stonehill College et dispensés au JPII pour les étudiants du JPII.
Au semestre d'automne, l'introduction à la production de médias numériques, un cours de niveau 200, présentera les principes et les éléments de la vidéo : caméra, éclairage, réalisation, montage, son et pratique de la composition vidéo.
Au semestre de printemps, les étudiants peuvent choisir le cours Critical Introduction to Criminal Justice, qui propose une introduction aux principales institutions de la justice pénale dans une perspective de sciences sociales. Ce cours examine la structure et le fonctionnement de la police, des tribunaux et des services correctionnels. Les théories et les concepts de la sociologie et d'autres disciplines seront utilisés pour décrire le fonctionnement du système de justice pénale et soulever des questions en vue d'une analyse critique.